Ključna razlika: Katolička Biblija sadrži izvorne četrdeset i šest knjiga Starog zavjeta (koje uključuju sedam knjiga apokrifa) i dvadeset sedam knjiga Novoga zavjeta. Protestantska Biblija uključuje samo trideset devet knjiga Starog zavjeta i dvadeset sedam knjiga Novog zavjeta.

Glavni problem pri razlikovanju između katolika i kršćanina javlja se kada mnogi ne shvaćaju da je rimokatolicizam sekta kršćanstva, baš kao i pravoslavna crkva i različite denominacije protestantizma. Denominacije protestantizma uključuju luteransku, baptističku, anglikansku, kalvinsku, kvekersku, šekersku, itd. Dakle, kada govorimo o katoličkim i kršćanskim Biblijama, zapravo govorimo o Bibliji koju koriste katolici odnosno protestanti.

Glavna razlika između katoličke i protestantske crkve je njihovo uvjerenje o Bibliji. Katolici smatraju da Biblija ima jednak autoritet s Crkvom i tradicijom, dok protestanti Bibliju vide kao vrhovni autoritet vjere i prakse.

Treba napomenuti da Biblija nije samo jedna knjiga; to je zbirka knjiga od spisa do povijesnih događaja. To je knjižnica priča o Isusovom životu, njegovim apostolima i njihovim životima nakon što je Isus umro na križu. Krajem 4. stoljeća, ovi različiti volumeni i priče uklopljeni su u jedan svezak, koji je u biti moderna biblija, kao što je znamo. Moderna Biblija sastoji se od dva dijela: Starog zavjeta i Novog zavjeta.

I katolička i protestantska Biblija uključuju Novi zavjet u istom formatu. Razlika nastaje u Starom zavjetu. Stari zavjet, uključen u protestantsku Bibliju, doživio je kanonizaciju doktrina ili knjiga. Kanonizacija je proces odabira koje knjige treba ostati i postati dio Biblije, a koje treba isključiti. Protestantska Biblija sadrži samo one knjige za koje se smatralo da su Božje riječi. Knjige i priče za koje se smatralo da ih je napisao 'čovjek' su isključene. Taj proces kanonizacije trajao je mnogo stoljeća.

Stari zavjet u izvornoj Bibliji bio je utemeljen na grčkom prijevodu židovskog pisma, nazvanom Septuaginta. Oko 100. godine, židovski rabini su revidirali svoje Pismo i uspostavili službeni kanon judaizma koji je isključivao neke dijelove grčkog Septuaginte.

Uklonjene knjige bile su Tobit, Judita, 1 Makabejci, 2 Makabejca, Mudrost (Solomonova), Siraha i Baruha. Uklonjeni su i dijelovi postojećih knjiga, uključujući Psalam 151 (iz Psalma), dijelove Knjige o Esteri, Suzani (iz Daniela kao poglavlje 13), i Bela i Zmaja (iz Daniela kao poglavlje 14).

Biblija je nastavila koristiti tekst izvornog Septuaginte kao Stari zavjet. Međutim, u 1500-ima, protestantski vođe odlučili su organizirati starozavjetni materijal prema službenom kanonu judaizma umjesto u Septuaginti. Razdijelili su Stari zavjet na dva dijela. Stari zavjetni materijal koji nije bio u židovskom kanonu bio je premješten u poseban dio Biblije nazvan apokrifa. Tako su protestantske Biblije sada uključivale tri dijela: dvadeset četiri knjige hebrejske Biblije podijeljene u trideset devet knjiga kao revidirani Stari zavjet, dvadeset sedam knjiga Novog zavjeta, uključujući četiri kanonska evanđelja, Djela apostolska., dvadeset i jednu poslanicu ili pismo i knjigu Otkrivenja, i sedam knjiga u apokrifima. U 19. stoljeću Apokrifa je naposljetku ispuštena iz protestantske verzije Biblije. Knjige apokrifa su također poznate kao deuterokanonske knjige.

Međutim, Rimokatolička crkva nije slijedila korake protestanata i nastavila je temeljiti svoj Stari zavjet na Septuaginti. Dakle, u osnovi katolička Biblija još uvijek sadrži izvorne četrdeset i šest knjiga Starog zavjeta (koje uključuju sedam knjiga Apokrifa) i dvadeset sedam knjiga Novog zavjeta. Protestantska Biblija, s druge strane, sada uključuje trideset devet knjiga Starog zavjeta i dvadeset sedam knjiga Novog zavjeta.